Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Smg8Q8VE18 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smg8Q8VE18 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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