Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lin28aQ8K3Y3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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