Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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