Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sde2Q8K1J5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms