Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkn3Q8K045 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Pkn3Q8K045 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkn3Q8K045 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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