Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms