Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms