Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slfn5Q8CBA2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn5Q8CBA2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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