Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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