Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms