Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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