Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms