Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Avl9Q80U56 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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