Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tnfsf18Q7TS55 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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