Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cspg5Q71M36 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cspg5Q71M36 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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