Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms