Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trak1Q6PD31 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trak1Q6PD31 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms