Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrimpolQ6P1E7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms