Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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NipblQ6KCD5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NipblQ6KCD5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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