Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms