Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms