Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt12Q64291 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt12Q64291 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt12Q64291 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt12Q64291 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms