Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e1Q64104 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr2e1Q64104 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms