Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a2Q62148 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a2Q62148 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms