Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot7Q60809 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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