Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms