Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms