Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Esf1Q3V1V3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms