Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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