Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chpf2Q3UU43 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms