Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Znf48Q3US17 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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