Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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