Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms