Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms