Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms