Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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