Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms