Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Colec11Q3SXB8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colec11Q3SXB8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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