Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms