Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp2Q08652 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms