Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CbfbQ08024 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms