Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms