Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cab39Q06138 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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