Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms