Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1sQ02789 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms