Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms