Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pde1bQ01065 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms