Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Taf1bP97358 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms