Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CiitaP79621 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms