Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tp53bp1P70399 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms